提问者:小点点

在R包中查找Rcpp函数


我想打印R包frailtysurv中的bh函数的C代码。 所以我输入:

> frailtySurv:::bh
function (d_, R_star, K_, Y_, N_, N_dot, beta, theta, frailty, 
    weights, abstol, reltol, maxit) 
{
    .Call("_frailtySurv_bh", PACKAGE = "frailtySurv", 
        d_, R_star, K_, Y_, N_, N_dot, beta, theta, frailty, 
        weights, abstol, reltol, maxit)
}
<bytecode: 0x0000025263262be0>
<environment: namespace:frailtySurv>

在相应的Github页面顶部显示以下警告:

# Generated by using Rcpp::compileAttributes() -> do not edit by hand

但是我在'frailtysurv'库中找不到src文件,也找不到另一个可以找到_frailtysurv_bh函数的文件。 包源中没有任何.rcpp函数的踪迹。 我知道为了打印.call调用的函数,类似的问题已经问过几次了(例如:here,here或here等等)。 这些对我的情况没有帮助。

关于在哪里可以找到_frailtysurv_bh函数的任何提示?

谢谢:-)


共1个答案

匿名用户

_frailtysurv_bh函数在rcppexports.cpp文件中定义,该文件在此处定义,如下所示:

RcppExport SEXP _frailtySurv_bh(SEXP d_SEXP, SEXP R_starSEXP, SEXP K_SEXP, SEXP Y_SEXP, SEXP N_SEXP, SEXP N_dotSEXP, SEXP betaSEXP, SEXP thetaSEXP, SEXP frailtySEXP, SEXP weightsSEXP, SEXP abstolSEXP, SEXP reltolSEXP, SEXP maxitSEXP) {
BEGIN_RCPP
    Rcpp::RObject rcpp_result_gen;
    Rcpp::RNGScope rcpp_rngScope_gen;
    Rcpp::traits::input_parameter< NumericVector >::type d_(d_SEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< List >::type R_star(R_starSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< List >::type K_(K_SEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< List >::type Y_(Y_SEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< List >::type N_(N_SEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< List >::type N_dot(N_dotSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< NumericVector >::type beta(betaSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< NumericVector >::type theta(thetaSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< String >::type frailty(frailtySEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< NumericVector >::type weights(weightsSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< double >::type abstol(abstolSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< double >::type reltol(reltolSEXP);
    Rcpp::traits::input_parameter< int >::type maxit(maxitSEXP);
    rcpp_result_gen = Rcpp::wrap(bh(d_, R_star, K_, Y_, N_, N_dot, beta, theta, frailty, weights, abstol, reltol, maxit));
    return rcpp_result_gen;
END_RCPP
}

您将看到它实际上是一个非常薄的包装器,用于名为bh的C++函数,它有点长,无法在这里再现,但在这里定义了它。