提问者:小点点

保存在闪亮应用程序中制作的绘图


我想知道如何使用downloadButton来保存具有光泽的绘图。包中的示例演示了如何使用downloadButton/downloadHandler来保存。csv。我将在此基础上制作一个可复制的例子。

对于ui。R

shinyUI(pageWithSidebar(
  headerPanel('Downloading Data'),
  sidebarPanel(
selectInput("dataset", "Choose a dataset:", 
            choices = c("rock", "pressure", "cars")),
    downloadButton('downloadData', 'Download Data'),
    downloadButton('downloadPlot', 'Download Plot')
  ),
  mainPanel(
    plotOutput('plot')
  )
))

对于服务器。R

library(ggplot2)
shinyServer(function(input, output) {
  datasetInput <- reactive({
    switch(input$dataset,
           "rock" = rock,
           "pressure" = pressure,
           "cars" = cars)
  })

  plotInput <- reactive({
    df <- datasetInput()
    p <-ggplot(df, aes_string(x=names(df)[1], y=names(df)[2])) +
      geom_point()
  })

  output$plot <- renderPlot({
    print(plotInput())
  })

  output$downloadData <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.csv', sep='') },
    content = function(file) {
      write.csv(datatasetInput(), file)
    }
  )
  output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
      ggsave(file,plotInput())
    }
  )
})

如果您正在回答此问题,您可能对此很熟悉,但要使其正常工作,请将上述内容保存到单独的脚本(ui.Rserver.R中,并保存到工作目录中的文件夹(foo)中。要运行闪亮的应用程序,请运行runApp(“foo”)

使用ggsave,我得到一条错误消息,指示ggsave不能使用filename函数(我想)。如果我使用标准图形设备(如下所示),下载绘图可以正常工作,但不会写入图形。

任何技巧,以获得下载Handler工作写情节将不胜感激。


共3个答案

匿名用户

不确定这个问题是否仍然有效,但这是搜索“在闪亮的应用程序中保存绘图”时出现的第一个问题,因此我想按照原始问题的思路快速添加如何让ggsave与downloadHandler一起工作。

juba建议的替代策略使用直接输出而不是ggsave,alexwhan建议的替代策略都非常有效,这只适用于那些绝对希望在下载处理程序中使用ggsave的人)。

alexwhan报告的问题是由gg保存试图将文件扩展名匹配到正确的图形设备引起的。但是,临时文件没有扩展名,因此匹配失败。这可以通过在函数调用中设置设备来解决,就像在原始代码示例中一样(对于png):

output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
        device <- function(..., width, height) grDevices::png(..., width = width, height = height, res = 300, units = "in")
        ggsave(file, plot = plotInput(), device = device)
    }
)

这个调用基本上为一个png调用设备函数,该函数在内部分配(您可以查看gg保存函数代码以查看jpgpdf的语法>等)。也许,理想情况下,可以指定文件扩展名(如果不同于文件名-就像这里临时文件的情况一样)作为gg保存参数,但此选项目前在gg保存中不可用。

一个最小的独立工作示例:

library(shiny)
library(ggplot2)
runApp(list(
  ui = fluidPage(downloadButton('foo')),
  server = function(input, output) {
    plotInput = function() {
      qplot(speed, dist, data = cars)
    }
    output$foo = downloadHandler(
      filename = 'test.png',
      content = function(file) {
        device <- function(..., width, height) {
          grDevices::png(..., width = width, height = height,
                         res = 300, units = "in")
        }
        ggsave(file, plot = plotInput(), device = device)
      })
  }
))

sessionInfo()
# R version 3.1.1 (2014-07-10)
# Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
# 
# locale:
#  [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
#  [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
#  [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
#  [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
#  [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
# [11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       
# 
# attached base packages:
# [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
# 
# other attached packages:
# [1] ggplot2_1.0.0 shiny_0.10.1 
# 
# loaded via a namespace (and not attached):
#  [1] bitops_1.0-6     caTools_1.17     colorspace_1.2-4 digest_0.6.4    
#  [5] formatR_1.0      grid_3.1.1       gtable_0.1.2     htmltools_0.2.6 
#  [9] httpuv_1.3.0     labeling_0.2     MASS_7.3-34      munsell_0.4.2   
# [13] plyr_1.8.1       proto_0.3-10     Rcpp_0.11.2      reshape2_1.4    
# [17] RJSONIO_1.3-0    scales_0.2.4     stringr_0.6.2    tools_3.1.1     
# [21] xtable_1.7-3    

从ggplot2 2.0版开始。0时,ggsave函数支持设备参数的字符输入,这意味着现在可以通过直接调用ggsave保存由downloadHandler创建的临时文件,方法是指定要使用的扩展名,例如“pdf”(而不是传入设备函数)。这将上述示例简化为以下内容

output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
        ggsave(file, plot = plotInput(), device = "png")
    }
)

匿名用户

我没有设法使它与gg保存一起工作,但是通过对png()的标准调用,它似乎是可以的。

我只更改了服务器的输出$DownloadPlot部分。r文件:

 output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
      png(file)
      print(plotInput())
      dev.off()
    })

请注意,我有一些问题与闪亮的0.3版本,但它适用于最新从Github:

library(devtools)
install_github("shiny","rstudio")

匿名用户

这里有一个解决方案,允许使用ggsave保存闪亮的绘图。它使用逻辑复选框和文本输入来调用ggsave()。将其添加到ui。R侧边栏面板中的文件

textInput('filename', "Filename"),
checkboxInput('savePlot', "Check to save")

然后将其添加到服务器。R文件,而不是当前的输出$plot反应式绘图功能:

output$plot <- reactivePlot(function() {
    name <- paste0(input$filename, ".png")
    if(input$savePlot) {
      ggsave(name, plotInput(), type="cairo-png")
    }
    else print(plotInput())
  })

然后,用户可以在文本框(不带扩展名)中键入所需的文件名,并勾选复选框以保存在应用程序目录中。取消选中该框将再次打印打印。我相信有更简洁的方法可以做到这一点,但至少我现在可以在windows中使用ggsave和cairo来获得更好的png图形。

请添加您可能有的任何建议。