NetworkX：如何将节点坐标分配为属性？

问题内容：

在这样的简单图形中：

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

G = nx.Graph()
G.add_edge('0','1')
G.add_edge('1','2')
G.add_edge('2','0')
G.add_edge('0','3')
G.add_edge('1','4')
G.add_edge('5','0')

pos={'0':(1,0),'1':(1,1),'2':(2,3),'3':(3,2),'4':(0.76,1.80),'5':(0,2)} #node:(x,y)
nx.draw(G,pos=pos,with_labels=True)
plt.show()

如果我尝试为每个节点分配一个包含节点ID及其(x,y)坐标的属性列表，如下所示：

for i,n in enumerate(G.nodes()):
    G.nodes()[i]['weight']=[G.nodes()[i],pos[n]] #List of attributes

我收到以下错误：

Traceback (most recent call last):

  File "<ipython-input-47-0f9ca94eeefd>", line 2, in <module>
    G.nodes()[i]['weight']=[G.nodes()[i],pos[n]]

TypeError: 'str' object does not support item assignment

怎么了

问题答案：

经过一番研究，我发现答案是正确的nx.set_node_attributes()。

当然可以将节点位置分配为属性：

pos={'0':(1,0),'1':(1,1),'2':(2,3),'3':(3,2),'4':(0.76,1.80),'5':(0,2)}    
nx.set_node_attributes(G, pos, 'coord')

导致

In[1]: G.nodes(data=True)
Out[1]:
[('1', {'coord': (1, 1)}), #each node has its own position
 ('0', {'coord': (1, 0)}),
 ('3', {'coord': (3, 2)}),
 ('2', {'coord': (2, 3)}),
 ('5', {'coord': (0, 2)}),
 ('4', {'coord': (0.76, 1.8)})]

并且还可以使用专用字典（在这种情况下test）附加多个属性，而不必与其中的节点拥有相同数量的元素G（例如，可以有没有属性的节点）：

test={'0':55,'1':43,'2':17,'3':86,'4':2} #node '5' is missing
nx.set_node_attributes(G, 'test', test)

导致

In[2]: G.nodes(data=True)
Out[2]:
[('1', {'coord': (1, 1), 'test': 43}),
 ('0', {'coord': (1, 0), 'test': 55}),
 ('3', {'coord': (3, 2), 'test': 86}),
 ('2', {'coord': (2, 3), 'test': 17}),
 ('5', {'coord': (0, 2)}),
 ('4', {'coord': (0.76, 1.8), 'test': 2})]

我推测使用可以对图形边缘进行同样的处理nx.set_edge_attributes()。

NetworkX：如何将节点坐标分配为属性？

微信关注